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以下为电子书和纸质书。个人认为技术是相通的。所以推荐一些R语言专门做生物信息的书的同时，也会推荐一些更广泛的，关于R语言使用的书籍。这些书籍，对R语言处理生物信息学问题，帮助也很多。 生物信息相关篇： 1.bioconductor （Bioconductor - Home）是R语言的一个项目，里面所有的包，都是使用R. • 替代方案 - 使用Bioconductor的AnnotationHub - 尝试AnnoProbe等专门用于GEO注释的R包 - 考虑在线转换工具如DAVID或g:Profiler 这个处理过程虽然有一定复杂性，但通过系统化的步骤和适当的代码实现，可以准确完成GPL17586平台的探针ID到gene symbol的转换。 如何使用Bioconductor进行RNA-seq数据分析？ 最近在进行RNA-seq数据分析，听说可以使用Bioconductor进行分析。 但对于Bioconductor的使用还不是很熟悉，想请教一下大家有没有… 显示全部 关注者 2 被浏览
底下给你打了几个比较常见的安装方法你可以试试： 1. 先安装limma包，然后再安装GEOquery包。 你可以用install.packages ("limma")来安装limma包，或者从Bioconductor网站上下载limma的源码包，然后用R CMD INSTALL命令来安装。 2. 或者是可以尝试更新你的R版本和Bioconductor版本。
R语言中，普通的R包和bioconductor的包有什么区别吗？ 阅读Bioconductor - Packages: Guidelines ，架构上bioconductor包很多都要参考R包的格式，但是具体的不同体… 显示全部 关注者 24 被浏览 R从bioconductor安装包很慢，以致卡断，有没有好的解决方法？ R从bioconductor安装包很慢，但是下载包到本地（用迅雷或网页直接下载）还行，以致卡断，有没有好的解决方法？ 显示全部 关注者 10 被浏览 在教学生物信息分析时，如何有效地使用Bioconductor、DESeq2、limma等工具包？ 最近在教学生物信息分析，想要让学生有效地使用Bioconductor、DESeq2、limma等工具包进行差异表达分析，但发现学生很难掌握这些工具包的… 显示全部 关注者 5
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